报废汽车的回收公司的注册流程和普通公司注册流程只有一点不同，就是需要向省自治区直辖市的经济贸易管理部门进行申请，并且获得资格认定书，再按照废旧金属收购业治安管理办法向机关申请特种行业许可证书，之后才能去工商管理部门办理登记手续，获得营业执照。
法律依据：《报废汽车回收管理办法》第规定:1、拟从事报废汽车回收拆解业务的，应当向省、自治区、直辖市经济贸易管理部门提出申请。
2、省、自治区、直辖市经济贸易管理部门应当自收到申请之日起30个工作日内，按照本办法第七条规定的条件对申请审核完毕。
3、特殊情况下，可以适当延长，但延长的时间不得超过30个工作日。
4、经审核符合条件的，颁发《资格认定书》;不符合条件的，驳回申请并说明理由。
5、申请人取得《资格认定书》后，应当依照废旧金属收购业治安管理办法的规定向机关申领《特种行业许可证》。
6、申请人持《资格认定书》和《特种行业许可证》向工商行政管理部门办理登记手续，领取营业执照后，方可从事报废汽车回收拆解业务。