协商解除劳动关系的流程是：1、解除劳动合同的提出：公司及员工均有权提出解除劳动合同;2、达成一致：双方在自愿、平等协商的基础上达成一致意见;3、通知工会：公司人事处将解除劳动合同的事由通知工会，由工会提出意见，在研究工会的意见后作出处理决定，并将处理结果通知工会;4、办理工作交接，由公司人事处安排相关员工办理工作交接;5、结算薪资和经济补偿：在员工办理完毕工作交接后，财务科应当结算并支付该员工的薪资;如是公司方提出解除合同，还应当结算并支付该员工的经济补偿;6、劳动合同解除：完成上述流程后，劳动合同按双方约定解除;7、将解除劳动合同的决定送达相对人(劳动者)，可以考虑直接(专递或快件)送达，乃至登报、公告送达等方式，必要时在可以考虑以公证的方式办理以上送达事宜，确保送达问题的万无一失。8、出具离职证明：在解除劳动合同时由人事处出具解除劳动合同的证明，并为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续;9、备案：对解除劳动合同的文本原稿、原电子档案以及劳动者违反劳动纪律的证据存档备案，至少保存两年。
一、劳动者单方解除劳动合同有工资吗
单方解除劳动合同也是有工资的，只要按正常的流程走用人单位是不能私自扣押的；员工解除劳动合同的程序是：
1、负责部门：人事处。
2、参与部门：人事处、财务处。
3、具体程序：
(1)人事处提供本单位的经过工会讨论并且走完公示程序的劳动纪律以及劳动规章制度，尤其是据以作出解除劳动合同的劳动纪律以及规章制度；
(2)人事处提供劳动者严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的事实以及证据；
(3)通知工会：公司人事处将解除劳动合同的事由通知工会，由工会提出意见，在研究工会的意见后作出处理决定，并将处理结果通知工会；
(4)办理工作交接，由公司人事处安排相关员工办理工作交接；
(5)结算薪资：在员工办理完毕交接手续后，财务处应当结算并给付劳动者薪资；
(6)劳动合同解除：在薪资结算完毕后，劳动合同解除；
(7)将解除劳动合同的决定送达相对人(劳动者)，可以考虑直接(专递或快件)送达，乃至登报、公告送达等方式，必要时在可以考虑以公证的方式办理以上送达事宜，确保送达问题的万无一失。
(8)出具离职证明：在解除劳动合同时由人事处出具解除劳动合同的证明，并为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续；
(9)备案：对解除劳动合同的文本原稿、原电子档案以及劳动者违反劳动纪律的证据存档备案，至少保存两年。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国劳动合同法》
第三条订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
第十条建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
第三十六条用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。